GSEA分析是个什么鬼

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解决时间 2021-02-01 15:15

提问者网友：不爱我么
2021-02-01 09:40

GSEA分析是个什么鬼

最佳答案

五星知识达人网友：走死在岁月里
2021-02-01 10:39

GSEA，基因探针富集分析，是基于评估来自微阵列的数据的各级别基因探针。
GSEA的初始版本是用来分析糖尿病人与正常人的肌肉活组织采样数据。分析显示，有某些基因牵涉到糖尿病人的氧化磷酸化作用的减弱，而其他独立的微阵列研究和活体功能研究中也证实了这个结果。
GSEA的使用方法是，使用者利用在权威刊物上发表过的相关生物学通路和实验得来的共表达数据，把基因探针分门别类，并根据相关性通过一系列运算，得出探针集是否能在表型上揭示出相关基因组的分布方式。

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1楼网友：三千妖杀
2021-02-01 11:38

基因集富集分析 (gene set enrichment analysis, gsea) 的基本思想是使用预定义的基因集（通常来自功能注释或先前实验的结果），将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序，然后检验预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集。基因集合富集分析检测基因集合而不是单个基因的表达变化，因此可以包含这些细微的表达变化，预期得到更为理想的结果。 gsea分析有三个特点：分析的基因集合而不是单个基因；将基因与预定义的基因集进行比较；富集分析；

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