16srRNA的测序结果怎么分析啊？谢谢！！！！！

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解决时间 2021-03-20 23:53

提问者网友：缘字诀
2021-03-20 01:46

最佳答案

五星知识达人网友：罪歌
2021-03-20 03:05

原核生物的30S核糖体亚基中含有16S rRNA.16S rRNA的相对分子质量约为0.6 MDa,长度约为1540 nt.在30S核糖体亚基组装过程中,16S rRNA与其核糖体蛋白质S4、S7、S8、S15、S17和S20结合先行成初级复合物.
16S rRNA约有一半的核苷酸形成链内碱基对,使其具有约60个螺旋；分子中未配对部分则形成突环.在浓度足够的Mg2+存在下分离得到的16S rRNA处于紧密状态,与30S核糖体亚基的结构相似.已发现16S rRNA中的一些序列与蛋白质合成时30S核糖体亚基、mRNA及一些翻译因子的结合有关.核糖体16S rRNA的3'端能识别待翻译mRNA的5'端的夏因-达尔加诺序列,起始翻译.另有研究表明,16S rRNA也能与进入核糖体P位点的tRNA相互作用.
16S rRNA作为研究分类学和系统进化的分子受到很大重视,16S rRNA序列分析是当前对细菌进行分类学研究中较精确的一种技术.随着分子生物学的快速发展以及该技术在医学微生物研究中的应用,对16S rRNA作为微生物分类依据的研究也逐渐发展起来并已得到广泛认同.
位于原核生物70S核糖体A位点的16S rRNA部分的是氨基糖苷类抗生素的作用靶位,该类抗生素通过与16S rRNA的A位点结合而阻碍原核翻译.但由质粒介导的16S rRNA甲基化酶能将16S rRNA甲基化,从而导致细菌产生对该类抗生素较高的抗药性.

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1楼网友：封刀令
2021-03-20 04:11

将拼接后的测序结果输入www. NCB I. n lm. n ih. gov/, 利用BLA ST 软件, 将测定得到的基因序列与Genbank数据库进行序列比对分析, 进行同源性比较,你可以找出与数据库中序列最相似，亲缘关系最近的物种，便可知道你的菌种

2楼网友：你可爱的野爹
2021-03-20 04:02

比较复杂，可以找公司做专业的生物信息学分析

3楼网友：枭雄戏美人
2021-03-20 03:10

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