怎样知道一个BAC 里面有多少个预测基因?

答案:2 悬赏:10 手机版

解决时间 2021-11-07 18:33

提问者网友：我没有何以琛的痴心不悔
2021-11-07 02:48

最佳答案

五星知识达人网友：持酒劝斜阳
2021-11-07 04:01

根据来源于大豆BAC克隆库中的基因组序列,与其比对的基因或蛋白质序列可以从一些数据库中搜索,如GenBank序列数据库、EMBL数据库、PDB数据库等,然后利用NCBI的Entrz程序在数据库中搜索大豆基因类似物,获取其登录号及核苷酸序列,以及这些基因编码的氨基酸序列,通过GENSCAN等软件分析,得出的是与拟南芥等物种序列比对的结果,根据GENSCAN的预测结果,可以初步得知序列长度、基因数目及具有编码某种功能蛋白的基因存在的可能性,进而对预测出的氨基酸或核苷酸序列利用数据库NCBI中的BLAST进行序列的相似性搜索及比对分析,寻找其保守区域。最后对其功能基因进行注释。

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1楼网友：归鹤鸣
2021-11-07 05:04

你是什么物种的BAC?知道BAC序列吗？通常是要先做BAC末端测序，通过两个末端序列匹配到已知基因组序列上，这样你想要的信息就都有了！

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