生物信息比对reads igv图像怎么看
答案:1 悬赏:70 手机版
解决时间 2021-03-24 15:59
- 提问者网友：雾里闻花香
- 2021-03-23 21:07
生物信息比对reads igv图像怎么看
最佳答案
- 五星知识达人网友：北城痞子
- 2021-03-23 22:27
生物信息比对reads igv图像怎么看
此处，map的意思是“比对到基因图上”；read是指测序出的一条序列，也称“读序”。 正在做RNA seq? RPKM, Reads Per Kb per Million reads RPKM=（10的9次方×C）/（N×L）。RPKM为某基因的表达量，C为唯一比对到该基因的reads数，N为唯一比对到参考基...
这个要看捕获KIT illumina最低一般50%多 agilent一般在70%多 nimblegen一般在85%左右 另外研究的物种也有一定影响，非模式生物的比对率会低一些 还有就是你研究物种的品系和设计探针捕获的参考数据的差一定也有关系。
此处，map的意思是“比对到基因图上”；read是指测序出的一条序列，也称“读序”。 正在做RNA seq? RPKM, Reads Per Kb per Million reads RPKM=（10的9次方×C）/（N×L）。RPKM为某基因的表达量，C为唯一比对到该基因的reads数，N为唯一比对到参考基...
这个要看捕获KIT illumina最低一般50%多 agilent一般在70%多 nimblegen一般在85%左右 另外研究的物种也有一定影响，非模式生物的比对率会低一些 还有就是你研究物种的品系和设计探针捕获的参考数据的差一定也有关系。
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