qPCR数据中对照组在表格中标准差怎么计算

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解决时间 2021-02-05 22:44

提问者网友：火车头
2021-02-04 22:21

最佳答案

五星知识达人网友：西风乍起
2021-02-04 22:54

先用average函数计算出平均数，然后用stdev函数就可以计算出标准差了。两个函数怎么用网上有无数教程

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1楼网友：行雁书
2021-02-05 00:30

3. real-time qpcr定量方法可以分为绝对定量和相对定量。绝对定量是用一系列已知浓度的标准品制作标准曲线，在相同的条件下目的基因测得的荧光信号量同标准曲线进行比较，从而得到目的基因的量。该标准品可以是纯化的质粒dna，体外转录的rna，或者是体外合成的ssdna。相对定量可以分为比较ct法和其他一些相对方法。比较ct指的是通过与内参基因ct值之间的相差来计算基因表达差异,也称之是2-ddct 。 3.1绝对定量从标准曲线获得线性方程： y=-3.432x+34.638;r2= 0.995, e=95%，所以可以进行数据分析。如果未知样品的 ct=25，代入方程： 25=-3.432x+34.638, 所以： x=2.8 copies=10^2.8 3.22-ddct定量 2-ddct方法使用的前提是内参和目的基因的扩增效率接近100%，且相差不超过5%。所用公式如下： 2-ddct=2-[(ct目的基因-ct内参基因)]处理组-[(ct目的基因-ct内参基因)]对照组 =2-[e-f]处理组-[a-b]对照组=2(f-b)-(e-a) 比如cdk5在处理前和处理后样品中的ct平均值是25和22.1；内参gapdh在处理前和处理后样品中的ct平均值是18.2和18.3.那么处理所致倍数变化(fold change)应该是 =2-[(22.1-18.3)]处理组-[(25-ct18.2)]对照组=23=8 也就是处理造成cdk5表达增加了7倍。如果是目的基因和内参基因的扩增效率相差比较大，可以用扩增效率进行校正，也就是pfaffl方法。所用公式如下：处理所致倍数变化(fold change)= c(a-e)/d(f-b) 扩增效率（e）=10-1/斜率(理想的pcr扩增效率=2) 百分比表示为：e%=(e-1)×100% 同时是上面例子，如果cdk5的扩增效率是70%；gapdh的扩增效率是95%，那么处理所致的倍数变化（fold change）应该是 =（1.7）（25-22.1）/(1.95)(18.3-18.2) =4.36 即处理造成cdk5表达量增加了3.36倍。

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