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乳杆菌16srDNA序列分析 先提取DNA然后PCR,扩增后纯化一下直接送去测序还是需要载体连接后才能送去测序?

答案:4  悬赏:40  手机版
解决时间 2021-02-17 15:22
  • 提问者网友:喧嚣尘世
  • 2021-02-16 16:52
乳杆菌16srDNA序列分析 先提取DNA然后PCR,扩增后纯化一下直接送去测序还是需要载体连接后才能送去测序?
最佳答案
  • 五星知识达人网友:轻雾山林
  • 2021-02-16 17:54
PCR纯化之后直接送测序也是可以的,但是测序结果前面有几十个碱基是不准确的
所以严格来讲还是应该克隆后再测序,选用克隆载体上的引物可以完整准确的测出16SR序列追问谢谢哦
全部回答
  • 1楼网友:西风乍起
  • 2021-02-16 21:46
不纯化也可以送测,测序结果回来取有效的一部分进行比对,如果相似性较低(97.5%左右),然后再做TA克隆,以获得16S的全长。(如果你要做新种鉴定的话)
直接测序的话,一开始的几十个bp不准确,而且几百个bp之后的序列可靠程度也不是很高。做完TA克隆再测序,基本上可以得到16S的全长。
  • 2楼网友:你哪知我潦倒为你
  • 2021-02-16 20:34
都可以的
  • 3楼网友:英雄的欲望
  • 2021-02-16 19:33
哇塞,期待高人,表示连题目都没看懂!
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