细胞提取总RNA检测RIN太低是什么原因?有什么方法解决
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解决时间 2021-12-31 06:55
- 提问者网友:听门外雪花风
- 2021-12-31 00:40
细胞提取总RNA检测RIN太低是什么原因?有什么方法解决
最佳答案
- 五星知识达人网友:行雁书
- 2022-01-22 05:26
RIN(RNA Integrity Number):RNA完整性计数,看你的RNA是不是完整,质量好不好,太低就说明降解严重~~~
其实提取RNA的条件没那么苛刻,在普通的通风橱里就可以操作,外源RNase的污染比较好消除,关键是破壁时的内源降解.如果用trizol法就必须考虑trizol的量.
另外,相同的方法提取不同细菌的RNA效果也不一样.比如霍乱用trizol法提取效果极差,而沙门菌提取效果就较好;所以霍乱菌最好是用试剂盒过柱子提取,然后浓缩.我提取的是大肠杆菌,摸索了好几种方法,最后确定也是qiagen 的kit提取,然后浓缩.
另外,有一种可以喷的液体,叫做RNase抑制剂,用于消除表面RNase的污染,在客观条件不是很好的时候很有效.
其实提取RNA的条件没那么苛刻,在普通的通风橱里就可以操作,外源RNase的污染比较好消除,关键是破壁时的内源降解.如果用trizol法就必须考虑trizol的量.
另外,相同的方法提取不同细菌的RNA效果也不一样.比如霍乱用trizol法提取效果极差,而沙门菌提取效果就较好;所以霍乱菌最好是用试剂盒过柱子提取,然后浓缩.我提取的是大肠杆菌,摸索了好几种方法,最后确定也是qiagen 的kit提取,然后浓缩.
另外,有一种可以喷的液体,叫做RNase抑制剂,用于消除表面RNase的污染,在客观条件不是很好的时候很有效.
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- 1楼网友:一秋
- 2022-01-22 06:26
RIN(RNA Integrity Number):RNA完整性计数,看你的RNA是不是完整,质量好不好,太低就说明降解严重~~~
其实提取RNA的条件没那么苛刻,在普通的通风橱里就可以操作,外源RNase的污染比较好消除,关键是破壁时的内源降解。如果用trizol法就必须考虑trizol的量。
另外,相同的方法提取不同细菌的RNA效果也不一样。比如霍乱用trizol法提取效果极差,而沙门菌提取效果就较好;所以霍乱菌最好是用试剂盒过柱子提取,然后浓缩。我提取的是大肠杆菌,摸索了好几种方法,最后确定也是qiagen 的kit提取,然后浓缩。
另外,有一种可以喷的液体,叫做RNase抑制剂,用于消除表面RNase的污染,在客观条件不是很好的时候很有效。
- 2楼网友:梦中风几里
- 2022-01-22 06:02
控制内源性的rna酶,一般注意样品的保存要得当,液氮,低温,或则采用rnakeeper这一类的药剂保存。此外,提取过程中,研磨组织时液氮,和trizol(华越洋)等试剂成分对rna酶都有抑制作用。研磨时液氮要充足,裂解液一定要充足话句话说如果试剂要足,严格按照类似产品说明书,一般情况是1ml处理01g。
对于外源性的rna酶的控制,首先保证实验环境的无rna酶话,台面,仪器,耗材,吸头,离心管等一定要处理,如果是用depc处理的话,一定要注意了,depc是致癌物质(建议考虑用致癌物depc替代品北京华越洋生物生产的,外源rna酶清除剂。稀释1000倍简单浸泡或喷洒处理上面的东西),其次一定要主要戴口罩和手套。 加油!
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