求助靶基因go分析，注释和富集

答案:2 悬赏:20 手机版

解决时间 2021-02-26 12:29

提问者网友：动次大次蹦擦擦
2021-02-26 01:23

求助靶基因go分析，注释和富集

最佳答案

五星知识达人网友：玩家
2021-02-26 02:25

blast2go软件可以做

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1楼网友：动情书生
2021-02-26 03:03

1. pathway功能分析及显著性判断　　对差异表达基因进行pathway功能分析，并计算pvalue进行显著性判断，pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。　　2. pathway中基因相关性分析　　根据每两个基因共出现在同一pathway中的次数统计，绘制基因共相关点线图，进而得到不同pathway上基因的关联情况。在分析工具上点击“cell differentiation”，在“term information”中描述了细胞分化术语的基本信息，包括树形及与父结点、子节点关系。　　对于未知基因名的序列，可以用序列直接检索go数据库。点击amigo首页上方的“blast”，进入检索界面。在检索框输入氨基酸或核酸序列或上传序列文件，检索工具能自动识别并相应地选择blastp或blastx来与数据库中的序列进行比对。以大肠杆菌dna聚合酶ⅱ基因polb为例，“high scoring gene products”栏内显示基因产物的名称、物种信息、p值。

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