一个物种的cds序列可以用来设计荧光定量PCR的引物吗？求高手指点迷津啊，先谢谢了！！！！
答案:3 悬赏:60 手机版
解决时间 2021-03-01 00:08
- 提问者网友：自食苦果
- 2021-02-28 04:12
一个物种的cds序列可以用来设计荧光定量PCR的引物吗？求高手指点迷津啊，先谢谢了！！！！
最佳答案
- 五星知识达人网友：往事埋风中
- 2021-02-28 05:45
可以啊 只要是mRNA上的就可以了 一般扩增产物长度150-200最好
全部回答
- 1楼网友：一秋
- 2021-02-28 07:38
可以。这就是传说中的qRT-PCR
- 2楼网友：拜訪者
- 2021-02-28 07:25
你好！
如果是用SYBR Green来做。设计的时候要跨外显子的交界区。这样能尽量避免扩增样本中残留的基因组DNA。
转录的时候，外显子和内含子一起被转录，这是序列和基因组DNA一样。剪切后才成为成熟RNA。如果设计引物的时候，至少有一个引物正好跨外显子的交界区。那么只有剪切后的RNA（cDNA）序列才能有效扩增。所以，使用cds序列的时候，先要做一下BLAST，找出交界区，定点设计。
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