进账支票用途填写的是货款，抬头未填，如果进账的话会不会跟税务有关？

第一方开的转账支票给第二方，但未填写收款人，用途填写的是货款.

第二方想交第三方帮忙进账，这会有什么影响？或者说要不要扣税什么的？

这样的话，就变成第一方和第三方的货款交易，第三方需要出具发票给第一方。

 税款与支票的支付无关。你如果是定税，无论如何也无关，如果不是定税，要按营业额来交税的。