NCBI BLAST search of P12653-00-00-01 against nr 是什么意思?

答案:3 悬赏:70 手机版

解决时间 2021-02-04 02:21

提问者网友：你挡着我发光了
2021-02-03 10:39

最佳答案

五星知识达人网友：有你哪都是故乡
2021-02-03 11:12

楼上的答非所问。

这句话的意思是在NCBI数据库中搜索一个编号为“P12653-00-00-01”的片段的反义核苷酸序列。

全部回答

1楼网友：独行浪子会拥风
2021-02-03 13:24

在NCBI的BLAST工具里比对序列号为P12653的蛋白质，其中database就是默认设置的nr(non-redundant protein sequence,蛋白质非冗余序列）找到的结果是： glutathione-S-transferase1 [Zea mays] >sp... Score bit： 443 Evalue ：6e-123

2楼网友：不想翻身的咸鱼
2021-02-03 12:15

NCBI NCBI(美国国立生物技术信息中心) Entrez 功能强大，在于它的大多数记录可相互链接，既可在同一数据库内链接，也可在数据库之间进行链接。当运用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列差异即进行相似性检索时，则会涉及到蛋白质库或核苷酸库的库内链接。库间链接发生在核苷酸数据库内的记录与PubMed库中已发表序列的引文间的链接，或蛋白质序列记录与核苷酸序列库中编码它的核苷酸序列间的链接。 NCBI数据库检索 NCBI数据库的检索方法很简单，在检索框中输入检索词，检索词间默认逻辑关系为AND，检索规则基本同PubMed。图2是显示检索结果页面。可以通过下拉菜单选择记录的显示格式，通常选择GenBank Report格式或FASTA Report格式。当选择GenBank Report格式后，屏幕显示较完整的基因记录，其内容包括：基因位点(Locus)、基因定义(Definition)、基因存取号(Accession)、核酸编号(NID )、关键词(Keywords)、来源(Source)、组织分类(Organism)、参考文献(Reference)、著者(Author)、题目(Title)、期刊Journal)、Medline存取号(Medline)、序列特征(Features)、基因(Gene)、CDS(cDNA)、等位基因(Allele) 对等的肽(Mat-Peptide )、计算碱基数(Base Count)、原序列(Origin)

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