重复序列的生物学意义
答案:1 悬赏:80 手机版
解决时间 2021-01-04 08:00
- 提问者网友：椧運幽默
- 2021-01-03 08:46
重复序列的生物学意义
最佳答案
- 五星知识达人网友：荒野風
- 2021-01-03 09:58
问题一：序列比对的重要性 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息 。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。问题二：RNAi的生物学意义是什么？ 朴素的讲，rnai是生物自然基因调控的手段之一珐它显示微小rna的重要作用。人们利用他抑制某些基因的表达，治疗疾病，做科学研究。问题三：高中生物短序列是什么 基因组中由寡核苷酸串联,重复排列的DNA序列,构成数量可变的串联重复序列,其中,微卫星DNA又称为短串联重复片列，是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广,高度多态性等特点,这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.
短序列比对中，一般常用的算法主要有三个：
（1） 空位种子片段索引法，如MAQ、ELAND等，首先将读段切分，并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位，通过轮换种子考虑允许出现错配（mismatch）的各种可能的位置组合；
（2） Burrows Wheeler转换法，如Bowtie、BWA、SOAP2等，通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引，再通过查找和回溯来定位读段，在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配；
（3） Smith-Waterman动态规划算法，如BFAST，SHRiMP等，利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值，并将结果存放于一个矩阵中，利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。问题四：信息生物学？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？ 1、使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。 在ncbi工具中搜索vecscreen——将序列复制粘贴到框中——运行---View report--
输出序列长度918、载体序列的区域456-854、可能使用的克隆载体都有pRKW2
pBR322、pGEM-13Zf(+)
2、使用相应工具，分析下列未知序列的重复序列情况，输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及Masked Sequence。
进入ncbi主页---选择blast—填入序列---blast---可看出来这个序列是人类的---搜索RepeatMasker---进入RepeatMasker主页---进入RepeatMasking---复制序列---DNA source选择human----运行---点连接---
重复序列的区域 类型 总长度 Masked Sequence屏蔽序列
313-381Simple_repeat69
720-769 LTR/ERVK 50
1082-1131 Simple_repeat50
3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具，分析下列未知序列，输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占的百分比及Obs/Exp值。
进入EMBL——TOOL——sequence analysis——cpgreport——输入序列——run——输出CpG岛的长度为385、区域48-432、GC数量297、所占的百分比为77.14及Obs/Exp值1.01。
4、预测下面序列的启动子，输出可能的启动子序列及相应的位置。
1. Google search ‘Neural Network Promoter Prediction’——choose ‘Neural Network Promoter Prediction’—选eukaryote真核生物—input this sequence-----submit
711-761 TCGCGCCACTATATGATCTGGGCGCCACTCTGGGTGACACAGCAAGACTC
1388-1438 AACCTCTGTGTCTAACGGGGGTGTGTGCTCTCCCTCCTCTGGCGACCATG
1755-1805 GCTGGTGGCATATATAGGGAGGGCTCGGCCTTGGCTCCACACTGGCTGCC
5、运用Splice Site Prediction工具分析下面序列，分别输出内含子－外显子剪接位点给体和受体的区域及剪接处位置的碱基。
由上序列解释看出是人类的序列---进入google首页，搜索Neural Network Promoter Prediction，进入主页，复制序列 选择Human or other----submit
内含子－外显子剪接位点给体 attccaggttggagg
受体的区域23-63
剪接处位置的碱基。caacctcctgccagccttcaggccactctcctgtgcctgcc
6、对下面序列进行六框翻译，利用GENESCAN综合分析(首先确定给定序列的物种来源)哪个ORF是正确的，输出六框翻译（抓图）和GENESCAN结果(包括predicted genes/e......余下全文>>问题五：试述细胞凋亡的生物学意义。 无论在发育期还是在成人体内，既有大量的新细胞产生，也有大量的旧细胞死亡，这是生物体的一种自然现象。为了维持机体组织中适宜的细胞数量，在细胞分裂和细胞死亡之间需要一种精确的动态平衡。由于这种生成与死亡的有序流程，在胚胎和成人期便维持着人体组织的适宜细胞数量。而这种精密地控制细胞的消亡过程就称为程序性细胞死亡。正常的生命需要细胞分裂以产生新细胞，并且也要有细胞的死亡，由此人体和生物的器官才得以维持平衡。
研究意义 细胞凋亡也帮助我们理解一些病毒和细菌侵袭人体细胞的机理。除了 A IDS，另外一些疾病，如神经变性性疾病、中风、心肌梗塞和自身免疫疾病等都是由于很多正常细胞被不正确地启动了程序性死亡过程而造成细胞过量死亡。
短序列比对中，一般常用的算法主要有三个：
（1） 空位种子片段索引法，如MAQ、ELAND等，首先将读段切分，并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位，通过轮换种子考虑允许出现错配（mismatch）的各种可能的位置组合；
（2） Burrows Wheeler转换法，如Bowtie、BWA、SOAP2等，通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引，再通过查找和回溯来定位读段，在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配；
（3） Smith-Waterman动态规划算法，如BFAST，SHRiMP等，利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值，并将结果存放于一个矩阵中，利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。问题四：信息生物学？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？ 1、使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。 在ncbi工具中搜索vecscreen——将序列复制粘贴到框中——运行---View report--
输出序列长度918、载体序列的区域456-854、可能使用的克隆载体都有pRKW2
pBR322、pGEM-13Zf(+)
2、使用相应工具，分析下列未知序列的重复序列情况，输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及Masked Sequence。
进入ncbi主页---选择blast—填入序列---blast---可看出来这个序列是人类的---搜索RepeatMasker---进入RepeatMasker主页---进入RepeatMasking---复制序列---DNA source选择human----运行---点连接---
重复序列的区域 类型 总长度 Masked Sequence屏蔽序列
313-381Simple_repeat69
720-769 LTR/ERVK 50
1082-1131 Simple_repeat50
3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具，分析下列未知序列，输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占的百分比及Obs/Exp值。
进入EMBL——TOOL——sequence analysis——cpgreport——输入序列——run——输出CpG岛的长度为385、区域48-432、GC数量297、所占的百分比为77.14及Obs/Exp值1.01。
4、预测下面序列的启动子，输出可能的启动子序列及相应的位置。
1. Google search ‘Neural Network Promoter Prediction’——choose ‘Neural Network Promoter Prediction’—选eukaryote真核生物—input this sequence-----submit
711-761 TCGCGCCACTATATGATCTGGGCGCCACTCTGGGTGACACAGCAAGACTC
1388-1438 AACCTCTGTGTCTAACGGGGGTGTGTGCTCTCCCTCCTCTGGCGACCATG
1755-1805 GCTGGTGGCATATATAGGGAGGGCTCGGCCTTGGCTCCACACTGGCTGCC
5、运用Splice Site Prediction工具分析下面序列，分别输出内含子－外显子剪接位点给体和受体的区域及剪接处位置的碱基。
由上序列解释看出是人类的序列---进入google首页，搜索Neural Network Promoter Prediction，进入主页，复制序列 选择Human or other----submit
内含子－外显子剪接位点给体 attccaggttggagg
受体的区域23-63
剪接处位置的碱基。caacctcctgccagccttcaggccactctcctgtgcctgcc
6、对下面序列进行六框翻译，利用GENESCAN综合分析(首先确定给定序列的物种来源)哪个ORF是正确的，输出六框翻译（抓图）和GENESCAN结果(包括predicted genes/e......余下全文>>问题五：试述细胞凋亡的生物学意义。 无论在发育期还是在成人体内，既有大量的新细胞产生，也有大量的旧细胞死亡，这是生物体的一种自然现象。为了维持机体组织中适宜的细胞数量，在细胞分裂和细胞死亡之间需要一种精确的动态平衡。由于这种生成与死亡的有序流程，在胚胎和成人期便维持着人体组织的适宜细胞数量。而这种精密地控制细胞的消亡过程就称为程序性细胞死亡。正常的生命需要细胞分裂以产生新细胞，并且也要有细胞的死亡，由此人体和生物的器官才得以维持平衡。
研究意义 细胞凋亡也帮助我们理解一些病毒和细菌侵袭人体细胞的机理。除了 A IDS，另外一些疾病，如神经变性性疾病、中风、心肌梗塞和自身免疫疾病等都是由于很多正常细胞被不正确地启动了程序性死亡过程而造成细胞过量死亡。
我要举报
如以上回答内容为低俗、色情、不良、暴力、侵权、涉及违法等信息，可以点下面链接进行举报！
点此我要举报以上问答信息
大家都在看
推荐资讯