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如何查找一个基因参与的代谢通路

答案:3  悬赏:30  手机版
解决时间 2021-11-13 02:57
  • 提问者网友:酱爆肉
  • 2021-11-12 23:49
如何查找一个基因参与的代谢通路
最佳答案
  • 五星知识达人网友:北方的南先生
  • 2021-11-13 00:20
代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAY database) 中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。
利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有 的代谢通路:
    先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。
    然后合理地安排EC号。
    最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物 结合起来。


全部回答
  • 1楼网友:西风乍起
  • 2021-11-13 01:24
一般现在的科技服务公司如果做了kegg pathway数据库注释的话,都会做代谢通路图的注释,可以从结果文件中的代谢通路图查找,找到想要的代谢通路图后,再分析哪些基因在基因组上存在。

  谢通路是kegg数据库里的pathway数据库。可以通过全基因组预测了编码基因后,进行pathway数据库注释,从注释结果的功能信息中通过关键字查找。一般都能找到。如果找不到,有可能是关键字不对或者基因组中没有这样的代谢通路功能基因。
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