如何采用QPCR检测超低表达的目的基因
答案:1 悬赏:70 手机版
解决时间 2021-01-06 17:10
- 提问者网友：無理詩人
- 2021-01-06 05:38
如何采用QPCR检测超低表达的目的基因
最佳答案
- 五星知识达人网友：痴妹与他
- 2021-01-06 05:50
如何采用QPCR检测超低表达的目的基因
如果避免了预扩增，数据可转换成绝对的cDNA数量，否则数据分析可以Cq值来开展，因为每个细胞的转录本水平呈对数正态分布。一开始，可以各种方法对数据作图，此外，基本的统计分析也应开展（如阳性细胞的数量、平均值和偏差）。细胞数量测定通常是以验证过的参考基因来均一化的。这种策略在单细胞分析中应避免，因为单个细胞中的所有转录本水平随时间变化。我们发现，校正分析和无监督算法（如Kohonen self-organizing maps）对定义亚群和基因网络很有用。Finn-Arne Weltzien（挪威兽医学院）
我们在利用单细胞qPCR进行定量测定时很小心。我们通常只进行定性分析。如果我们定量，我们会利用目的基因的拷贝数相对参考基因的拷贝数。Weiwen Zhang（亚利桑那州立大学，现在天津大学）
对于每个单细胞，我们对目的基因和参考基因进行qPCR分析，如原核生物的16s rRNA和真核生物的28s或actin。不过，我们也注意到，这些常用参考基因的表达水平在单细胞中也差别很大，对大量细胞qPCR的标准定量法则也须特别谨慎。在大部分情况下，我们报告原始和均一化的Ct值，并使用它们进行单细胞qPCR结果的定量。Q6：您分析时使用哪些生物信息学工具？Mikael Kubista（TATAA生物中心）
如果避免了预扩增，数据可转换成绝对的cDNA数量，否则数据分析可以Cq值来开展，因为每个细胞的转录本水平呈对数正态分布。一开始，可以各种方法对数据作图，此外，基本的统计分析也应开展（如阳性细胞的数量、平均值和偏差）。细胞数量测定通常是以验证过的参考基因来均一化的。这种策略在单细胞分析中应避免，因为单个细胞中的所有转录本水平随时间变化。我们发现，校正分析和无监督算法（如Kohonen self-organizing maps）对定义亚群和基因网络很有用。Finn-Arne Weltzien（挪威兽医学院）
我们在利用单细胞qPCR进行定量测定时很小心。我们通常只进行定性分析。如果我们定量，我们会利用目的基因的拷贝数相对参考基因的拷贝数。Weiwen Zhang（亚利桑那州立大学，现在天津大学）
对于每个单细胞，我们对目的基因和参考基因进行qPCR分析，如原核生物的16s rRNA和真核生物的28s或actin。不过，我们也注意到，这些常用参考基因的表达水平在单细胞中也差别很大，对大量细胞qPCR的标准定量法则也须特别谨慎。在大部分情况下，我们报告原始和均一化的Ct值，并使用它们进行单细胞qPCR结果的定量。Q6：您分析时使用哪些生物信息学工具？Mikael Kubista（TATAA生物中心）
我要举报
如以上回答内容为低俗、色情、不良、暴力、侵权、涉及违法等信息，可以点下面链接进行举报！
点此我要举报以上问答信息
大家都在看
推荐资讯