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如果我们采用一条基因组序列对Swiss Prot数据库进行blastx搜索,Frame都可能有哪些显示方式。

答案:1  悬赏:10  手机版
解决时间 2021-01-07 09:14
  • 提问者网友:难遇难求
  • 2021-01-07 01:03
如果我们采用一条基因组序列对Swiss Prot数据库进行blastx搜索,Frame都可能有哪些显示方式。
最佳答案
  • 五星知识达人网友:何以畏孤独
  • 2021-01-07 01:18
总的而言有下列12种

0 = pairwise,显示具体匹配信息(缺省)
1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域,显示一致性
2 = query-anchored no identities,查询-比上区域,不显示一致性
3 = flat query-anchored, show identities,查询-比上区域的屏文形式,显示一致性
4 = flat query-anchored, no identities,查询-比上区域的屏文形式,不显示一致性
5 = query-anchored no identities and blunt ends,查询-比上区域,不显示一致性,无突然的结束
6 = flat query-anchored, no identities and blunt ends,查询-比上区域的屏文形式,不显示一致性
7 = XML Blast output,XML格式的输出
8 = tabular,TAB格式的输出
9 =tabular with comment lines,带注释行的TAB格式的输出
10 =ASN, text,文本方式的ASN格式输出
11 =ASN, binary [Integer] default = 0,二进制方式的ASN格式输出
但是如果你在网站上进行,一般就为2-5种,如0 = pairwise, 8 = tabular,7 = XML Blast output,看你在哪个站点进行了
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