不准确为什么基因测序的结果一般会认为序列两端不
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解决时间 2021-01-25 12:43
- 提问者网友:火车头
- 2021-01-24 23:55
不准确为什么基因测序的结果一般会认为序列两端不
最佳答案
- 五星知识达人网友:孤独入客枕
- 2021-01-25 01:30
不准确为什么基因测序的结果一般会认为序列两端不
是有参考基因组的还是de novo的结果,如果有参考基因组的,那么可以通过这个基因名称在注释结果中查找是否有这个基因,序列信息需要在参考基因组中查找,如果是没有参考基因组的,那么拼接结果是一个fasta格式的文件,可以用blast软件进行比对。
克隆出来基因序列并测序之后,通常先要鉴定这个序列是不是符合我们要求的,通常用生物信息学的方法,去ncbi做一个blastx,通过比对结果来判断这个序列是什么基因,此外,blastx结果会给出比对的方向,很容易就可以判定你测序的那条序列是正向的还是反向的,如果是反向的,那么就需要把它进行互补翻转,就得到了编码氨基酸的有义链了,许多软件都可以实现互补翻转的,如editseq,dnaman等.
是有参考基因组的还是de novo的结果,如果有参考基因组的,那么可以通过这个基因名称在注释结果中查找是否有这个基因,序列信息需要在参考基因组中查找,如果是没有参考基因组的,那么拼接结果是一个fasta格式的文件,可以用blast软件进行比对。
克隆出来基因序列并测序之后,通常先要鉴定这个序列是不是符合我们要求的,通常用生物信息学的方法,去ncbi做一个blastx,通过比对结果来判断这个序列是什么基因,此外,blastx结果会给出比对的方向,很容易就可以判定你测序的那条序列是正向的还是反向的,如果是反向的,那么就需要把它进行互补翻转,就得到了编码氨基酸的有义链了,许多软件都可以实现互补翻转的,如editseq,dnaman等.
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- 1楼网友:迟山
- 2021-01-25 01:43
测序结果与ncbi gene blast~看有没有突变是不是100%匹配等~
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