3730测序仪的测序结果中的高噪音影响是指什么?
答案:2 悬赏:50 手机版
解决时间 2021-02-20 22:14
- 提问者网友:咪咪
- 2021-02-20 02:21
3730测序仪的测序结果中的高噪音影响是指什么?
最佳答案
- 五星知识达人网友:拾荒鲤
- 2021-02-20 03:21
我们一般看测序结果中,一个重要的参数是其信噪比,即为有效信号/背景噪音。高噪音影响就是低信噪比。信噪比越低结果越不可靠。
噪音是有2层含义的:狭义上是本底噪音,由系统误差造成;广义上为非目的片段的测序信号。
这么说来可能就有两种情况:
1、系统误差造成,系统误差的噪音本身是很低的,如果是这种情况,那就说明信噪比的分母有关:有效信号太低;大多数与样品浓度低,或者样品与引物不匹配有关。总不可能无中生有吧?没有东西,总测不出有效信号吧?
2、非目的片段测序信号造成:这种情况有高有低,算作与信噪比的分母有关。测序就是半个PCR,对应到PCR里就类似扩增特异性差,出现Smear条带,难于认清主条带,这样会容易理解点吧?这种情况一般与引物的特异性差和测序模板质量低下有关。
噪音是有2层含义的:狭义上是本底噪音,由系统误差造成;广义上为非目的片段的测序信号。
这么说来可能就有两种情况:
1、系统误差造成,系统误差的噪音本身是很低的,如果是这种情况,那就说明信噪比的分母有关:有效信号太低;大多数与样品浓度低,或者样品与引物不匹配有关。总不可能无中生有吧?没有东西,总测不出有效信号吧?
2、非目的片段测序信号造成:这种情况有高有低,算作与信噪比的分母有关。测序就是半个PCR,对应到PCR里就类似扩增特异性差,出现Smear条带,难于认清主条带,这样会容易理解点吧?这种情况一般与引物的特异性差和测序模板质量低下有关。
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- 1楼网友:人间朝暮
- 2021-02-20 04:58
额
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