【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？

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解决时间 2021-01-12 01:26

提问者网友：你挡着我发光了
2021-01-11 22:00

最佳答案

五星知识达人网友：举杯邀酒敬孤独
2021-01-11 22:57

swingman8(站内联系TA)NCBI，用blast寻找相似序列，只能说是相似性比较，用软件构件进化树才能分析同源性，应该是这样，我现在的问题是会画树，不会分析，急死人啊新人小玥(站内联系TA)用clusterW或clusterX进行多重比对，得到的数据可以用MAGA来做树。
用clusterW或clusterX进行多重比对，得到的数据可以用MAGA来做树。
我也是不会分析，还请指教你可以把需要比对的序列用fasta格式保存在记事本里，然后用clustalW/clustalX的多重比对选项，直接按它默认的算法算算，生成的.dnd格式拿到MAGA里面的phylogeny——display newick tree from file选项中打开。就成了进化树了。可以在里面调整成你想要的表示方法和顺序，另存为就好了。
还有就是用DNAMAN , 多重比对（画了多条线并横着排列的标志multiple alignment），点了之后，将fasta格式保存的文件打开，选择是DNA还是蛋白质，然后以默认程序运算，出现的界面中选output——tree——最后一个，就有树了。你可以以不同的方式调整，然后输出。
如果还不行，你可以去网上搜搜相关说明书，那里会有比较详细的步骤。
希望能帮到你哈！

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