如何通过pfam数据库构建隐马尔科夫模型文件

如何通过pfam数据库构建隐马尔科夫模型文件

马尔科夫过程可以看做是一个自动机，以一定的概率在各个状态之间跳转。
考虑一个系统，在每个时刻都可能处于N个状态中的一个，N个状态集合是 {S1,S2,S3,...SN}。我们现在用q1,q2,q3,…qn来表示系统在t=1,2,3,…n时刻下的状态。在t=1时，系统所在的状态q取决于一个初始概率分布PI，PI(SN)表示t=1时系统状态为SN的概率。
马尔科夫模型有两个假设：
1. 系统在时刻t的状态只与时刻t-1处的状态相关；（也称为无后效性）
2. 状态转移概率与时间无关；（也称为齐次性或时齐性）
第一条具体可以用如下公式表示：
P(qt=Sj|qt-1=Si,qt-2=Sk,…)= P(qt=Sj|qt-1=Si)
其中，t为大于1的任意数值，Sk为任意状态
第二个假设则可以用如下公式表示：
P(qt=Sj|qt-1=Si)= P(qk=Sj|qk-1=Si)
其中，k为任意时刻。

如以上回答内容为低俗、色情、不良、暴力、侵权、涉及违法等信息，可以点下面链接进行举报！

点此我要举报以上问答信息